Satul Ghidighici este situat la 7 km distanță de capitala Republicii Moldova și la 12 km distanță de sediul primăriei municipiului Chișinău.
Se învecinează cu hotarele satului Sireț din raionul Strășeni și cu satul Grătiești din municipiul Chișinău.
Așezarea este localizată într-o vale care se deschide din stânga în valea râului Bîc. Fauna din zonă include șopârle, șerpi și diverse specii de păsări. Locuitorii întrețin animale domestice precum bovine și porcine.
Satul se află la coordonatele geografice de 47.0513011 latitudine și 26.02111 longitudine, conform meridianului din Paris.
Este înconjurat de dealuri și este învecinat cu așezările Ţîglău, Ponor, Hîrtop și Sireț.
Suprafața totală a satului este de 2378 hectare.
